碧云寺位于本嶼大寮莊山頂，即上福村與大福村之間，恰當琉球嶼之中心，主奉觀世音菩薩，小琉球居民無論婚喪喜慶、求姻緣、問生病、求漁船滿載等等，必前來求簽請示，是鄉民最重要的精神信仰。

碧云寺位于琉球嶼的中心，興建于1736年，至今已有200多年歷史，主祀觀音菩薩。鄉民無論婚嫁擇日，吉兇卜卦等事，均前來請求觀音佛祖指引，是全鄉的信仰中心。

1980年，已故蔣經國先生因視察鄉政抵達琉球鄉，曾親臨此廟，并捐獻香油錢一千元，而讓該寺聲名遠播。

碧云寺下方設有步道可觀賞竹林生態濕地，漫步其間，陽光自樹縫間灑落，一片清爽，夜晚點點燈光投射下，片片竹林伴隨潺潺流水，隨風搖曳作響，蛙鳴聲此起彼落。

在清朝雍正年間（公元一七二三～一七三五年），有一位籍叫田深氏者，自打狗遷移至本嶼杉板路居?。榻裆细４逄锸献嫦龋?，那時他在今碧云寺前園宅內構建一座小茅舍從事牧羊。有一夜，他夢見南海普陀山觀音佛祖要他在此地建立廟寺，田氏驚醒，感念佛祖的靈顯，于是遍告島民，共同計劃將他的土地損獻出來建廟，就在乾隆元年（公元一七三六年）建立一座草廟名為「觀音亭」。并雕刻佛像，永為敬拜，據說鄉民求卜都很靈驗，因此香火鼎盛。

碧云寺交通：

(1)北及中南部游客，可經由省道１號高速公路南下，由小港機場出口沿省道１７號公路，往東港行駛即可抵達東港碼頭，在碼頭搭船往小琉球，至島上再租機車環島。

(2)東部游客，可經由省道９號公路，往楓港方向接省道１號公路，往枋寮、林邊到東港碼頭，在碼頭搭船往小琉球，至島上再租機車環島。