清水巖位于康定路與長沙路街交叉口，主祀清水祖師，故有人稱為清水巖或清水巖，也有人稱它為祖師廟。清水祖師，臺灣民間習慣稱祂祖師公、烏（黑）面祖師、蓬萊祖師、落鼻祖師等等稱呼不一。清水祖師為北宋人，生于福建省，俗家名傳說不一，有陳昭、陳應、陳昭應。自幼習佛悟道，曾在蓬萊山的山巖構筑一間小精舍修行，由于巖洞內之的水清澈冷冽，精舍被稱為清水巖（巖），此為清水祖師名稱的由來。

相傳清水祖師在清水巖內修行時，有鬼怪用大火將祖師燻得面目全黑，而祖師卻是毫髮未傷，烏（黑）面祖師由此而來。而落鼻祖師之稱，是因為傳說每當祖師廟附近有災難將要發生時，祖師的鼻子就會自動脫落下來，以警示居民與信眾。

于清水巖的龍、虎二堵墻壁可見磚雕圖騰，正門對聯書：為清水，為蓬萊，此地并分法界；是金身，是鐵面，入門便見真容。皆為1817年的重修藝術作品。另外值得一提的是古匾方面，有光緒皇帝御賜功資拯濟匾額一面。